马塞诸斯州大学波士顿

发育中的细胞信号传导和基因调控

博士，发育生物学，加州大学圣地亚哥分校，La Jolla， CA, 2000

MS，分子生物学，莫斯科国立大学，莫斯科，俄罗斯，1994

• 杨玲，Paul S, DuBois-Coyne S, Kyriakakis P, Veraksa A（2017）果蝇胚胎提取液的蛋白质组学研究。视觉实验学报，33(4):481 - 481。
• Yang， L.和Veraksa， A.（2017）利用链亲和素结合肽（SBP）标签一步亲和纯化ERK信号复合物。中国生物医学工程学报，2014,33(4):444 - 444。
• Yang L, Paul S, triieu KG, Dent LG, Froldi F, forres M, Webster K, Siegfried KR, Kondo S, Harvey K, Cheng LY, Jimenez G, Shvartsman SY, Veraksa A (2016) Minibrain and Wings apart通过降低Capicua调控器官生长和组织模式。《美国科学院学报》（PNAS） 13, 10583-10588。
• 张超，Robinson BS，徐伟，杨玲，姚波，赵宏，卞鹏飞，金鹏，Veraksa A, Moberg KH（2015）脱皮激素受体共激活因子Taiman与Yorkie在体细胞组织中生殖系干细胞因子转录调控的联系。发育细胞34,168-180。
• 张晓明，张晓明，张晓明，陈晓明，陈晓明，陈晓明（2015）GTPase调控蛋白Pix和Git通过Hippo途径调控组织生长。当代生物，25,124-130。
• 杨建军，徐伟，聂勇，陈建军，陈建军，陈建军。(2013)β-抑制蛋白与SUMO蛋白酶Ulp1的相互作用。遗传学报（自然科学版）；
• Veraksa， A.（2013）发育过程的调控：基于质谱的蛋白质组学的见解。电线与发展生物学报，2,723-734。(邀请审查)
• Degoutin JL, Milton CC, Yu E, Tipping M, Bosveld F, Yang L, Bellaiche Y, Veraksa A, Harvey KF。（2013） Riquiqui和Minibrain是Dachsous下游Hippo通路的调节因子。自然细胞生物学15,1176-1185。
• Gilbert, m.m., Tipping, m.m., Veraksa， A.和Moberg， K.（2011）条件生长抑制基因筛选鉴定果蝇HD-PTP同源物作为癌蛋白Yorkie的调节因子。发育细胞20,700-712。
• Tipping， M, Kim， Y., Kyriakakis， P., Tong， M., Shvartsman， S.Y.和Veraksa， A. (2010) β-阻滞蛋白Kurtz抑制果蝇发育中的MAPK和Toll信号。EMBO杂志29,3222-3235。
• Veraksa， A.（2010）当多肽飞行：果蝇蛋白质组学的进展。蛋白质组学学报，30(3):558 - 557。
• Lake， R.J, Grimm, l.m., Veraksa， A, Banos， A.和Artavanis-Tsakonas， S. (2009) Notch受体S1切割的体内分析。科学通报4(8),2001,26。
• Yelleswarapu, c.s., Tipping， M, Kothapalli, s.r., Veraksa， A.和Rao， D.V.（2009）共径多模态光学显微镜。光学快报34,1243-1245。
• Kyriakakis， P., Tipping， M., Abed， L.和Veraksa， A.（2008）果蝇串联亲和纯化：GS-TAP系统的优势。飞2,229-235。
• Omori， Y., Zhao， C., Saras， A., Kim， W., Mukhopadhyay， S., Kim， W., Furukawa， T., Sengupta， P., Veraksa， A.和Malicki， J. (2008) elipsa是纤毛发生的早期决定因素，它将IFT颗粒与膜相关的小GTPase Rab8联系起来。自然细胞生物学10,437-444。
• Mukherjee， A.*, Veraksa， A.*, Bauer， A., Rosse， C., Camonis， J., Artavanis-Tsakonas， S. (2005) Notch信号的非视觉β抑制调控。自然细胞生物学7,1191-1201。（*）等额捐款。
• Veraksa， A., Bauer， A.和Artavanis-Tsakonas， S.（2005）用串联亲和纯化-质谱法分析果蝇的蛋白质复合物。发展动态，32,827-834。
• Moberg, k.h., Mukherjee， A., Veraksa， A., Artavanis-Tsakonas， S., Hariharan， I.K.（2004）果蝇F-box蛋白群岛在体内调节dMyc蛋白水平。当代生物14,965-974。

专业经验

• 2012-至今：马萨诸塞大学波士顿分校生物系副教授。
• 2005-2012，麻省大学波士顿分校生物系助理教授。
• 2000-2005年，哈佛大学医学院MGH肿瘤中心、细胞生物系博士后。
• 1994-2000：在加州大学圣地亚哥分校生物系和耶鲁大学生物系从事博士研究。

奖项及荣誉

• 2002-2003年：MGH医学发现基金博士后奖学金。
• 1995-2000：霍华德休斯医学研究所博士预科奖学金。

研究兴趣

我们研究的长期目标是研究后生动物发育过程中控制细胞通讯的机制。这些控制机制的失调导致发育异常，是多种人类疾病的原因。了解细胞用来传递细胞内信号的方式，有望使我们更接近相关疗法，并能够创造出具有所需特性的新细胞功能。

在过去的十年中，发育信号通路的研究已经从映射事件的线性链转变为探索相互作用网络之间的联系。我的实验室正在应用网络生物学的工具来分析发育信号通路。我们对发育信号网络的研究是通过使用果蝇作为实验系统来促进的。我们方法的优势在于将蛋白质组学方法与在同一实验室进行的即时功能验证相结合。

实验室目前的研究项目有：

1. 通过ERK和Minibrain的协调活动调节器官生长和组织模式

转录抑制因子Capicua （Cic）是器官生长和组织模式的保守调节因子，人类Cic基因的突变可导致脑癌少突胶质细胞瘤。Cic活性受受体酪氨酸激酶(RTK)/ERK信号通路控制。我们最近发现了激酶Minibrain (Mnb)/DYRK1A及其接头Wings apart (Wap)/DCAF7是独立于其他生长控制途径抑制Cic活性的新型Cic调节因子。因此，Cic作为多个上游信号的积分器，汇聚到该蛋白上，以控制组织模式和器官生长。我们目前的工作旨在阐明这些信号通路的活动在发育过程中是如何协调的。考虑到Cic和Minibrain （DYRK1A）的人类同源基因在这些疾病中的作用，这项工作与理解癌症和唐氏综合症等人类疾病有关。

2. 果蝇β-抑制蛋白库尔茨（Krz）的信号功能

本实验室对果蝇β-抑制蛋白库尔茨（Krz）的信号功能分析做出了重要贡献。我们之前的研究确定了Krz作为Notch信号调节剂，调节Notch受体的周转。我们实验室的后续工作揭示了它在果蝇胚胎发生过程中调节受体酪氨酸激酶躯干和Toll/NF-κB信号通路的作用。我们发现Krz通过一种以前未知的隔离机制抑制ERK信号。最近，我们发现Krz通过限制Toll通路的活性，在控制果蝇幼虫的免疫稳态中发挥重要作用，Toll通路是通过Krz与SUMO蛋白酶Ulp1的关联而发生的。因此，Krz已成为多种信号通路的信号中枢，我们正在继续研究其相互作用网络及其在发育信号传导控制中的作用。

3. 对河马通路的新认识

我们的实验室已经确定了果蝇中河马/约克信号通路的重要新调节器。Hippo通路是一种保守的发育机制，负责调节器官生长。我们实验室在蛋白质组学实验中发现了这种途径的新调节因子，并在与Moberg和Harvey实验室的合作中得到了生物学验证。我们正在继续研究Hippo通路和新成分的生物学特性。

4. 发育蛋白质组学

我们的实验室正在不断开发有效的方法来纯化和分析发育中的重要信号复合物。我们应用亲和纯化-质谱（AP-MS）方法来分析果蝇的发育信号。我们已经使用这种方法来研究Notch信号通路，以及通过受体酪氨酸激酶/ERK和Hippo/Yorkie信号通路的信号。我们在发育蛋白质组学领域的专业知识已经导致了许多富有成效的合作。我们还通过分发用于蛋白质标记和纯化的DNA载体，以及分享蛋白质组学专业知识，为科学界服务。