两名麻省大学波士顿分校的研究人员获得了大众生命科学基金
110万美元将用于乳房x线摄影数据库、下一代测序项目

“这些前沿项目是我们教师做出重要研究贡献的例子……”
在麻省生命科学中心(MLSC)最近的资助周期中,由麻省大学波士顿分校教师领导的两个研究项目被选中获得总计110万美元的奖励。
MLSC的Bits to Bytes项目为生成和分析大型数据集的项目提供资助,以回答紧迫的生命科学问题,该项目授予俄勒冈-马萨诸塞州乳房x线摄影数据库(OMAMA-DB) 75万美元。该项目由计算机科学助理教授Daniel Haehn领导。
MLSC的开放资本计划为支持马萨诸塞州生命科学生态系统的最先进设备和基础设施提供资助,为名为“下一代测序:马萨诸塞州大学波士顿CPCT基因组学核心”的项目提供38.8万美元。该项目由Alton J. Brann捐赠主席兼杰出大学科学与数学教授Jill Macoska领导,以及风险发展总监William Brah,数学副教授Kourosh Zarringhalam和Genomics核心经理Susan Patalano-Salsman。
马萨诸塞大学波士顿分校校长Marcelo Suárez-Orozco说:“这些前沿项目是我们教师为创造新知识做出重要研究贡献的例子。”“我祝贺Haehn博士和Macoska博士在提高我们对复杂人类问题的理解和寻找解决方案方面取得的持续进展。”

海恩教授(左)看着一名拿着GPU的学生。
OMAMA-DB旨在开发大量数据,以帮助训练现代深度学习系统,以便及早发现乳腺癌。Haehn说,手工生成这些数据非常耗时。因此,OMAMA-DB项目将设计智能标注方法,将机器学习算法与人工标注相结合,以提高标注吞吐量。
Haehn说:“与当地一家医疗成像公司合作,我们将创建世界上最大的公开可用的注释乳房x光摄影数据集,并微调现有的自动乳腺癌检测分类器。”“我们非常感谢获得比特到字节奖。这笔资金将使我们能够通过新的gpu和快速存储大规模升级校园计算资源。”
该团队的其他成员包括马萨诸塞大学波士顿分校的计算机科学家Nurit Haspel、Marc Pomplun和Dan Simovici;阿列克谢·托尼什金的物理学;以及合伙人DeepHealth的比尔·洛特和格雷格·索伦森。
根据马科斯卡的说法,人类疾病的遗传基础可以通过人类基因组的NextGen(“深度”)测序来发现。个性化癌症治疗中心(CPCT)基因组学核心功能是通过为先进的基因组学研究和开发提供一个非常成功和制度变革的平台,为学术和企业用户提供这一功能。
Macoska说:“Core专门支持技术上有困难或‘有风险’的项目,帮助形成阶段的想法向前推进,以确定潜在的可行性,特别是关于未来的临床应用。”“该项目旨在通过为领先的学术和企业用户引入新的测序技术和服务,延续这一势头,填补基因组学支持服务的关键空白。”
马萨诸塞大学波士顿分校深深植根于这座城市的历史,但也准备好应对未来的挑战。波士顿的公立大学以创新研究而闻名,为其多样化的学生群体提供了亲密的学习环境和丰富的美国城市体验。马萨诸塞大学波士顿分校的学院和研究生院为16000名学生提供服务,同时通过学术课程、研究中心和公共服务吸引当地和全球选民。欲了解更多信息,请访问www.umb.edu