高斯
高斯函数在嵌合体上可用。虽然高斯算法能够在分布式内存配置中运行,但我们要求用户将单个运行限制在共享内存节点上,因为高斯算法对带宽的需求很大。这可以在chimera上提交作业时使用“高斯”并行环境来完成。
对于打算在chimera上使用高斯的用户,您需要首先联系我们,以便将您的用户名添加到高斯组,然后才能运行作业。
一个非常简单的作业提交脚本可能是这样的:
#!/bin/bash #$-S /bin/bash # #01:00:00是1小时运行#num_proc=32请求一个32核节点#h_vmem=64G内存请求为您的程序#$-l h_rt=01:00:00,num_proc=32,h_vmem=64G #$-q清零。smp #$-P SCAVENGER #$-N yourJobName #并行环境和进程数#‘高斯’ pe限制到单个节点(共享内存)#$-pe高斯32 #$-cwd # # #诊断/日志信息echo "using $NSLOTS cpu " echo “ date ”
模块加载高斯函数。$ g09root / g09 / bsd / g09.profile
#作业命令g09 inputfilename.gjf .gjf
#诊断/日志信息echo "Finish Run" echo “end time is'date ”